Im Anwendungsfach Biowissenschaften des Masterstudiengangs Angewandte Informatik werden die naturwissenschaftlichen Grundlagen durch interdisziplinäre Veranstaltungen vertieft (z.B. Biophysikalische, Bioorganische und Bioanorganische Chemie). Das Vertiefungspraktikum für die Bioinformatik (BI 309) ist der interdisziplinären Forschung an der Schnittstelle zwischen Informatik und Biowissenschaften gewidmet.
Die Vertiefungsrichtungen aus dem Bachelorstudiengang werden im Masterstudiengang fortgesetzt.